Chov hospodářských zvířat je nedílnou součástí většiny zemědělských činností. Zaměřuje se především na výrobu a jen okrajově jsou zvířata zřizovány za účelem pobytu hostů na farmách. Podnikatel v agroturistice svým hostům zpravidla umožňuje blíže poznat život na venkově, farmu a v neposlední řadě i chov hospodářských zvířat. Hosté tak mají možnost asistovat při některých formách péče, krmení a práce se zvířaty jako je dojení, stříhání vlny, mohou se podílet na výrobě některých produktů – výroba sýrů, uzení masa nebo slaniny, a jejich následné konzumaci.
2.1. Nejrozšířenější zvířata v agroturistice
Nejčastěji chovanými druhy zvířat jsou hovězí a mléčný skot, ovce a kozy. Ta jsou ideálními kandidáty pro agroturistiku, protože kromě produkce masa, mléka a vlny je lze využívat také k údržbě krajiny. Kromě toho lze pro účely agroturistiky za běžně chovaná zvířata považovat také drůbež (kachny, husy, krůty, kuřata, holuby atd.), prasata, králíky nebo včely.
Nejdůležitějším zvířetem využívaným v agroturistice je však kůň. Chov koní poskytuje řadu možností jejich využití i v jiných sférách než jen v zemědělství. Koně jsou v cestovním ruchu velmi oblíbení, a to jak koně jezdečtí, tak i kočároví, a jsou hojně využíváni při jezdeckých soutěžích, závodech a dostizích. Využívají se také k různým hrám – koňskému fotbalu, koňskému pólu nebo modernímu pětiboji.
Intervence s asistencí zvířat (AAI – Animal Assisted Interventions) mají terapeutický, rehabilitační, vzdělávací a rekreační charakter, a rovněž zahrnují využití domácích zvířat. Správná aplikace AAI vyžaduje zapojení multidisciplinárního týmu, který je schopen zvládnout složité situace v rámci vztahu mezi člověkem a zvířetem. V závislosti na typu zásahu se skládá ze zdravotnických, pedagogických a technických pracovníků s různými úkoly a zodpovědnostmi. Na základě oblastí činnosti se AAI dělí na: Terapie s asistencí zvířat (TAA), Vzdělávání s asistencí zvířat (EAA) a Aktivity s asistencí zvířat (AAA).
2.2. Využití netradičních zvířat v agroturistice
Kromě tradiční zemědělské výroby se provozovatelé agroturistických zařízení snaží zvýšit atraktivitu svých zařízení pro návštěvníky také chovem netradičních druhů zvířat, ať už se jedná o stará nebo zájmová plemena hospodářských zvířat – okrasné druhy drůbeže, miniaturní prasata, malá nebo ohrožená plemena ovcí a koz – například quesantské ovce, kamerunské kozy, osli, nebo zvířata zcela netypická pro místní prostředí jako jsou lamy, jaci, buvoli, pštrosi nebo zvířata, která nejsou hospodářskými zvířaty jako jsou bizoni, klokani nebo krokodýli.